Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GKN1Q9NS71 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms