Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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