Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 214.81□□□□□ -0.049e-17■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.829e-17■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.99e-17■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-220ENST00000471270 657 ntTSL 224.46■■□□□ 1.514e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-222ENST00000477206 589 ntTSL 218.88■□□□□ 0.614e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-224ENST00000480056 544 ntTSL 318.51■□□□□ 0.554e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.24e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-217ENST00000465025 783 ntTSL 216.25■□□□□ 0.194e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.044e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-26■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 211.75□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 210.48□□□□□ -0.734e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-227ENST00000583217 599 ntTSL 210.35□□□□□ -0.754e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 27.75□□□□□ -1.174e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-210ENST00000578569 583 ntTSL 27.08□□□□□ -1.284e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.51□□□□□ -1.694e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 CCT4-203ENST00000461540 638 ntTSL 32.61□□□□□ -1.994e-7■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-210ENST00000584583 429 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-20■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.824e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.444e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.44e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-216ENST00000496738 2405 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-217ENST00000498722 1348 ntTSL 217.39■□□□□ 0.374e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 216.67■□□□□ 0.264e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 8.2
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-218ENST00000578380 310 ntTSL 323.51■■□□□ 1.359e-38■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-203ENST00000586077 3053 nt9.4□□□□□ -0.91e-13■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.334e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.334e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 417.14■□□□□ 0.334e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 217.08■□□□□ 0.324e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.094e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 04e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 214.8□□□□□ -0.044e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 213.52□□□□□ -0.254e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 211.21□□□□□ -0.614e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 39.92□□□□□ -0.824e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.914e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -14e-11■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.311e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 322.16■■□□□ 1.145e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 522.04■■□□□ 1.129e-15■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 221.12■□□□□ 0.975e-7■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.911e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.872e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.762e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 318.97■□□□□ 0.631e-13■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-215ENST00000599558 385 ntTSL 217.48■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 317.21■□□□□ 0.355e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-213ENST00000599278 295 ntTSL 316.29■□□□□ 0.25e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-211ENST00000555039 270 ntTSL 515.44■□□□□ 0.061e-13■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-10■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-10■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 513.49□□□□□ -0.259e-15■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 GANAB-208ENST00000528503 608 ntTSL 211.51□□□□□ -0.578e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 COPS6-208ENST00000474823 752 ntTSL 211.36□□□□□ -0.598e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 TPM4-213ENST00000591226 2672 nt11.36□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 TPM4-207ENST00000588032 712 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-203ENST00000517830 320 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.699e-15■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-206ENST00000468810 597 ntTSL 310.28□□□□□ -0.766e-16■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.819e-15■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB9-207ENST00000524241 654 ntTSL 27.7□□□□□ -1.182e-12■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 27.64□□□□□ -1.199e-15■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-206ENST00000482860 2599 ntTSL 26.18□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 55.71□□□□□ -1.55e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-204ENST00000449323 422 ntTSL 34.24□□□□□ -1.736e-16■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-208ENST00000478196 580 ntTSL 24.24□□□□□ -1.736e-16■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.765e-9■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 23.79□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 TPM4-214ENST00000591645 653 ntTSL 32.47□□□□□ -2.011e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 25.7 ms