Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP2Q9NPB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms