Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms