Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN28AQ9H9Z2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN28AQ9H9Z2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms