Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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