Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms