Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms