Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms