Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUF2Q9BZD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms