Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms