Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms