Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GATA5Q9BWX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATA5Q9BWX5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms