Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms