Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TINF2Q9BSI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TINF2Q9BSI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms