Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGMATQ9BSE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGMATQ9BSE5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms