Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms