Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIKE1Q9BRV8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms