Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms