Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms