Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms