Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP4Q99569 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP4Q99569 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms