Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR78Q96P69 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms