Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms