Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms