Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX3Q96JJ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms