Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms