Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms