Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RCN3Q96D15 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RCN3Q96D15 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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