Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms