Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO3Q8TAP4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms