Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP61Q8NHU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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