Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHQ1

CEP70, Centrosomal protein of 70 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP70Q8NHQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP70Q8NHQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP70Q8NHQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms