Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms