Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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