Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF38AQ8NAV1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms