Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms