Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms