Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms