Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC71Q8IV32 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC71Q8IV32 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms