Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAPLN4Q86UW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAPLN4Q86UW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms