Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC8DQ7L1W4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8DQ7L1W4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8DQ7L1W4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8DQ7L1W4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms