Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms