Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPTNQ6XPR3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPTNQ6XPR3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms