Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM88Q6PEY1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms