Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM104BQ5XKR9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms