Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CEP170Q5SW79 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms