Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms