Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms